MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha710 chromosome

Total Repeats: 40015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017505	TATCCA	2	12	15	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327373
2	NC_017505	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385327373
3	NC_017505	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385327373
4	NC_017505	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327373
5	NC_017505	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385327373
6	NC_017505	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385327373
7	NC_017505	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327373
8	NC_017505	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385327373
9	NC_017505	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327374
10	NC_017505	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385327374
11	NC_017505	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385327374
12	NC_017505	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385327374
13	NC_017505	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385327374
14	NC_017505	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385327374
15	NC_017505	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327375
16	NC_017505	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327375
17	NC_017505	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327375
18	NC_017505	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327375
19	NC_017505	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
20	NC_017505	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	385327375
21	NC_017505	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385327375
22	NC_017505	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
23	NC_017505	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385327375
24	NC_017505	GC	3	6	1497	1502	0 %	0 %	50 %	50 %	385327375
25	NC_017505	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327375
26	NC_017505	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385327375
27	NC_017505	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385327375
28	NC_017505	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
29	NC_017505	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
30	NC_017505	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385327375
31	NC_017505	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
32	NC_017505	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385327375
33	NC_017505	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327375
34	NC_017505	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327375
35	NC_017505	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327375
36	NC_017505	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327375
37	NC_017505	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327375
38	NC_017505	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327375
39	NC_017505	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385327375
40	NC_017505	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327375
41	NC_017505	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327375
42	NC_017505	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385327375
43	NC_017505	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385327375
44	NC_017505	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327375
45	NC_017505	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327375
46	NC_017505	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385327375
47	NC_017505	A	6	6	2523	2528	100 %	0 %	0 %	0 %	385327376
48	NC_017505	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327376
49	NC_017505	T	7	7	2590	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	385327376
50	NC_017505	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385327376
51	NC_017505	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327376
52	NC_017505	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385327376
53	NC_017505	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385327376
54	NC_017505	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385327376
55	NC_017505	GC	3	6	2801	2806	0 %	0 %	50 %	50 %	385327376
56	NC_017505	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327376
57	NC_017505	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	385327376
58	NC_017505	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327376
59	NC_017505	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327376
60	NC_017505	T	6	6	3152	3157	0 %	100 %	0 %	0 %	385327376
61	NC_017505	GCCT	2	8	3186	3193	0 %	25 %	25 %	50 %	385327377
62	NC_017505	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327377
63	NC_017505	GAT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385327377
64	NC_017505	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327377
65	NC_017505	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327377
66	NC_017505	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327377
67	NC_017505	CG	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	385327377
68	NC_017505	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385327377
69	NC_017505	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327377
70	NC_017505	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327377
71	NC_017505	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327377
72	NC_017505	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327377
73	NC_017505	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327377
74	NC_017505	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385327377
75	NC_017505	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327378
76	NC_017505	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327378
77	NC_017505	TGCC	2	8	3812	3819	0 %	25 %	25 %	50 %	385327378
78	NC_017505	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	385327378
79	NC_017505	CAAA	2	8	3909	3916	75 %	0 %	0 %	25 %	385327378
80	NC_017505	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327378
81	NC_017505	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	385327378
82	NC_017505	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	385327379
83	NC_017505	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327379
84	NC_017505	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385327379
85	NC_017505	CGG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327380
86	NC_017505	CAA	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327380
87	NC_017505	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327380
88	NC_017505	GAA	2	6	4654	4659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385327380
89	NC_017505	AAC	3	9	4736	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327380
90	NC_017505	CGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327380
91	NC_017505	CCAGC	2	10	4773	4782	20 %	0 %	20 %	60 %	385327380
92	NC_017505	CTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327380
93	NC_017505	CGA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327380
94	NC_017505	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327380
95	NC_017505	TCG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327380
96	NC_017505	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327380
97	NC_017505	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327381
98	NC_017505	CG	3	6	4997	5002	0 %	0 %	50 %	50 %	385327381
99	NC_017505	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327381
100	NC_017505	CCG	3	9	5170	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327381
101	NC_017505	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327381
102	NC_017505	GC	3	6	5214	5219	0 %	0 %	50 %	50 %	385327381
103	NC_017505	ACA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385327381
104	NC_017505	AGA	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385327381
105	NC_017505	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385327381
106	NC_017505	CGCC	2	8	5365	5372	0 %	0 %	25 %	75 %	385327381
107	NC_017505	TTTC	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	385327381
108	NC_017505	AGA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385327381
109	NC_017505	GC	3	6	5599	5604	0 %	0 %	50 %	50 %	385327381
110	NC_017505	CGT	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327381
111	NC_017505	CCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327381
112	NC_017505	CCTT	2	8	5626	5633	0 %	50 %	0 %	50 %	385327381
113	NC_017505	CCG	3	9	5662	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327381
114	NC_017505	GCT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385327381
115	NC_017505	CT	3	6	5697	5702	0 %	50 %	0 %	50 %	385327381
116	NC_017505	TTC	2	6	5763	5768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327381
117	NC_017505	CCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385327381
118	NC_017505	A	6	6	5868	5873	100 %	0 %	0 %	0 %	385327381
119	NC_017505	T	6	6	6050	6055	0 %	100 %	0 %	0 %	385327382
120	NC_017505	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385327382
121	NC_017505	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385327382
122	NC_017505	CG	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	385327382
123	NC_017505	GCAC	2	8	6155	6162	25 %	0 %	25 %	50 %	385327382
124	NC_017505	GCC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327382
125	NC_017505	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327382
126	NC_017505	AAT	2	6	6211	6216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385327382
127	NC_017505	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327383
128	NC_017505	AGC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385327383
129	NC_017505	GGCA	2	8	6312	6319	25 %	0 %	50 %	25 %	385327383
130	NC_017505	CGC	2	6	6350	6355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327383
131	NC_017505	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327383
132	NC_017505	CCG	2	6	6421	6426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385327383
133	NC_017505	GCTTT	2	10	6442	6451	0 %	60 %	20 %	20 %	385327383
134	NC_017505	TCGAAC	2	12	6496	6507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385327383
135	NC_017505	CGG	3	9	6566	6574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385327383
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